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鼠源性抗雄性特异性抗原噬菌体 Fab 抗体库的构建

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发表于 2019-10-7 11:11:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
鼠源性抗雄性特异性抗原噬菌体 Fab 抗体库的构建


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 楼主| 发表于 2019-10-7 11:21:03 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-7 19:40 编辑

摘要 :
方法:利用雄鼠脾细胞免疫 6~7 周龄 C57BL/ 6 雌鼠,加强免疫后取脾细胞 ,Trizol法提取细胞总 RNA , 并逆转录合成 cDNA 第一条链。以其为模板 ,利用特异性 I g 基因的引物 PCR 扩增出重链 Fd 片段和κ链基因 ,并将扩增出基因重组到噬质粒载体 pComb3 中,重组噬质粒转化大肠杆菌 XL1-Blue 中 ,分别构建κ链基因库和抗体 Fab 段基因库。
结果:轻链、 重链 Fd 段基因的重组率均为 80 %。抗体 Fab 段基因库经过辅助噬菌体 VCSM13 超感染 ,成功构建了鼠源性噬菌体 Fab 抗体库。并测定噬菌体抗体库的库容和滴度 ,结果分别为 1. 5 × 10^7,3. 2 × 10^11 pfu/ mL 。对噬菌体抗体库的 18 个克 隆进行 ELISA 分析 , 结果显示以雄鼠脾细胞作为抗原时 ,有 9 个克隆含有雄性特异性的噬菌体抗体 ,而以雄鼠睾 丸细胞作为抗原时 ,有 8 个克隆与睾丸细胞呈现结合活性。
结论:噬菌体抗体库的构建为雄性特异性抗原的鼠源性噬菌 体抗体 Fab 片段的筛选及其应用、 雄性特异性抗原和抗体功能性分子基础的研究奠定了坚实基础。



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 楼主| 发表于 2019-10-7 17:35:24 | 显示全部楼层
Fab: 分子由轻链(VL-CL)和重链(VH-CH1;Fd 片段)组成

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 楼主| 发表于 2019-10-7 19:26:20 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-9 20:55 编辑

背景资料:
    雄性特异性抗原(Male specific antigen) 通常也称为雄性特异性弱组织相容性Y抗原(Male specific minor histocompatibility Y antigen) ,又称H-Y抗原,是一组雄性特异性表达的基因产物,在异性间组织移植的排斥反应和性别控制等方面的研究中具有重要的理论和实践意义。
     噬菌体抗体库技术是近年来发展起来的以噬菌体展示技术为基础的一种抗体筛选技术。噬菌体展示抗体技术比常规方法制备的抗体的多样性高10^10倍 ,并作为高生产量的系统来分析抗原与抗体的相互作用。
    本研究首次采用噬菌体抗体库技术制备H2Y抗体,希望有助于哺乳动物后代的性别控制研究(?)

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 楼主| 发表于 2019-10-7 19:39:43 | 显示全部楼层
实验主要用材料
大肠杆菌菌株XL1-Blue,该菌株为重组缺陷型,允许M13 噬菌体超感染。
pComb3 载体是噬菌体表面Fab 段表达载体,含氨苄青霉素(amp) 的抗性基因,载体大小为4 029 bp。
辅助噬菌体VCSM13
HRP-羊抗M13
6 周龄雄性和雌性C57BL/ 6 小鼠,体重15g 左右。

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 楼主| 发表于 2019-10-7 21:27:20 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-7 22:43 编辑

模板制备:Trizol法提取RNA cDNA 第一条链的合成
6~7 周龄C57BL/ 6 小鼠,用雄鼠脾细胞免疫8 只雌鼠(编号1~8) ,每只雌鼠腹腔内以0. 5mL 的体积注射5 ×10^7 个雄鼠脾细胞(以PBS 稀释,并加5 %的牛胎儿血清) 。
最后1 次免疫后10 d,雌鼠眼眶采血,制备H2Y 抗血清,无菌分离脾脏,脾脏约0. 15 g 。
通过经典的精子细胞毒试验和ELISA 检测方法对H2Y抗血清检测,选择免疫效果较好的雌鼠,将脾脏制脾细胞悬液(1~5 ×10^6 ) ,
离心收集细胞,Trizol法提取RNA, 甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测电泳条带以28S rRNA 和18S为主,总RNA 浓度约为2. 2μg/μL 。
RNA反转录后获得cDNA第一条链。



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 楼主| 发表于 2019-10-7 23:19:57 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-9 19:39 编辑

Fab 段的轻链和重链Fd 基因的扩增
小鼠重链可变区引物
5′引物5′primer 5′TGG AGG CTT CTC SA G GTG MA G CTK CAS SAR TCW GG 3′
3′引物3′primer 5′TGG GGS TGT YGT ACT A GT TGM RGA GAC RGT GA 3′
小鼠轻链κ可变区引物
5′引物
P1 5′CAT GGA GCTC GAC ATT GTT GTG ACT CA G GAA TCT 3′
P2 5′CAT GGA GCTC GAC ATT GTG TTG ACG CA G CCG CCC 3′
P3 5′CAT GGA GCTC GAC ATT GTG CTC ACC CAG TCT CCA 3′
P4 5′CAT GGA GCTC GAC ATT SWG ATG ACM CA G TCT CCA 3′
P5 5′CAT GGA GCTC GAC ATT GTS ATG ACC CAG WCT CCA 3′
3′引物3′primer 5′GCG CCG TCT A GA ATT AAC ACT CAT TCT A GA CCG TTT 3′
K= G/ T ,M = A/ C ,S = C/ G,R = A/ G,W = A/ T , Y= C/ T ,B = C/ G/ T ,D = A/ G/ T , H = A/ C/ T ,V = A/ C/ G,Rest riction sites
are X ho ⅠCTCGA G, S pe ⅠACTA GT , S ac ⅠGA GCTC , Xba ⅠTCTA GA
PCR 反应条件为:94 ℃ 15 s ,55 ℃ 50 s ,72 ℃ 1. 5 min ,共进行30 个循环,最后72 ℃延长10 min
以cDNA 第一链为模板,分别以轻链和重链Fd段基因的3′端引物和5′端引物(共6 对) 进行PCR反应,分别扩增出Fd 段和轻链。
显示在约680 bp 处可见明显的扩增条带(如图1 ,图2) ,与理论值相符。其中,轻链扩增出三对,重链扩增出一对。

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 楼主| 发表于 2019-10-9 20:57:17 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-10 13:59 编辑

K链和抗体Fab 片段基因库的构建:
κ链片段经Sac Ⅰ和Xba Ⅰ双酶切后,插入到噬粒pComb3中,构建轻链基因文库。

菌落PCR法轻链重组质粒,显示在10 个克隆中有8 个为阳性克隆(见图3) ,重组率约为80%。
 



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 楼主| 发表于 2019-10-10 14:03:18 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-10 14:22 编辑

进一步用Sac I和 Xba I对轻链基因的噬粒进行酶切鉴定
本文中用到的图

和作者在硕士论文鼠源性抗雄性特异性抗原噬菌体Fab抗体库的构建与筛选中P31页用到的图一致

质粒的酶切电泳图,小条带和大条带之间的亮度之比和两个片段大小之比呈现正相关,酶切后的小条带亮度会弱,大条带亮度强,此图左图中的酶切电泳图明显存在问题,切下来的轻链基因更接近PCR条带的亮度。右图的酶切结果更接近真实的酶切电泳图。

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 楼主| 发表于 2019-10-10 14:24:02 | 显示全部楼层
本帖最后由 米小圈 于 2019-10-10 14:58 编辑

抗体Fab 片段基因库的构建:
将轻链库和重链Fd 段用S pe I 和X ho I 双酶切,回收后连接,构建Fab库。
酶切鉴定Fab重组质粒,显示在10 个克隆中有8 个为阳性克隆( 见图5) ,重组率约为80 %,库容量为1. 5 ×10^7。 
和作者在硕士论文鼠源性抗雄性特异性抗原噬菌体Fab抗体库的构建与筛选中P32页用到的图一致

这个酶切电泳图存在明显的问题有:
1. 和图4同样的问题,酶切后大小条带的亮度和实际不符合,切下来的Fd条带亮度更接近PCR结果。
2. pCOMB3质粒全长4029bp,插入了轻链基因后质粒长4.7KB左右。如果重链基因没有成功插入到轻链基因的质粒中,用Xba I 和X ho I 双酶切后,应该得到的条带是1.7kb(载体PCOMB3上Xba I 和X ho I 两酶切位点之间的片段以及插入的轻链基因)和3kb的条带,而不会是5.3kb的条带。
图中带4和带10的条带和理论值不符合。

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