Broadly neutralizing monoclonal antibodies against human adenovirus......

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生信分析

HAdV11 (3exv.1.A),HAdV14p (3f0y.1.A), HAdV14p1 (4zdg.1.B), HAdV7(3exw.1.A) 病毒的纤毛蛋白头的晶体结构模型在PDB蛋白数据库中都有相应记录。http://www.rcsb.org/
用软件PyMOL v0.99进行分子结构分析。
氨基酸251KE252位于纤毛蛋白头F-G环处，靠近G环β-折叠，理论上推测会破坏F-G环结构以及和临近的纤毛蛋白单体之间的结合。两个氨基酸的缺失破坏了一个小的α-螺旋，(248SREKE252) 。

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分子对接
从100,000杂交瘤细胞中提取总RNA，RT-PCR扩增出单抗的轻重链核苷酸序列，IMGT/V-QUEST分析抗体序列。
Molecular Operating Environment (MOE) v2018.01软件用于抗体分子的模建。ClusPro用于进行抗原-抗体分子的对接。

A：MAb 3F11和蛋白HAdV11FK之间的结合界面. 分子间有强烈相互作用的位点用stick小棍图来显示，抗体的位点标记绿色，抗原位点标记兰青色。有很强的极性相互作用，如氢键或者盐桥，用浅蓝色破折线标记。图中可见HAdV11FK蛋白的R249,K251,E252和单抗3F11的CDR H1/H2区有很强的极性作用。
B: Overview of the docked
complex of the antigen HAdV11FK and the antibody Fv, superimposed with HAdV14p1FK. The protein backbones are shown in ribbons. The antigen
HAdV11 is colored in yellow, and HAdV14p1FK is colored in magenta. The antibody Fv is colored in dark green (FR), purple (CDR-L1/L2/L3), brown
(CDR-H1/H2), and red (CDR-H3), respectively. The location of E252 on the antigen is colored in cyan
The skeleton conformation
changed from the helix of HAdV11FK to the loop of
HAdV14p1FK, which may be the primary cause of the
failure to bind to the antibody (Fig. 7b).

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讨论部分摘要：
Wang等报道HAdV14P1 纤维蛋白头缺失了两个氨基酸并不显著改变纤维蛋白头和hDSG2的亲和力

本研究中，用 HAdV11FK作为抗原制备了三株具有型交叉性中和活性的单抗，能和HAdV11, -7, -14p,以及 -55结合。
利用单抗MAb 3F11鉴定到一个fiber上的空间表位。