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楼主: 黄帮主

常见融合蛋白标签

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 楼主| 发表于 2020-7-26 19:13:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-3-12 01:00 编辑

NuSA标签蛋白
NusA 是大肠杆菌自身的一种蛋白,即转录抗终止因子,分子量为54.87KDa
NusA tag(转录终止/抗终止蛋白标签)不具有独立的纯化标签功能,需要和其他标签(如His标签)联用,可提高蛋白质的溶解性,但由于分子量较大,对蛋白下游应用会有影响。
NusA 不具有独立的纯化标签功能,所以要与其它标签(如His 标签)联用。
核苷酸序列,1482nt
aacaaagaaattttggctgtagttgaagccgtatccaatgaaaaggcgctacctcgcgagaagattttcgaagcattggaaagcgcgctggcgacagcaacaaagaaaaaatatgaacaagagatcgacgtccgcgtacagatcgatcgcaaaagcggtgattttgacactttccgtcgctggttagttgttgatgaagtcacccagccgaccaaggaaatcacccttgaagccgcacgttatgaagatgaaagcctgaacctgggcgattacgttgaagatcagattgagtctgttacctttgaccgtatcactacccagacggcaaaacaggttatcgtgcagaaagtgcgtgaagccgaacgtgcgatggtggttgatcagttccgtgaacacgaaggtgaaatcatcaccggcgtggtgaaaaaagtaaaccgcgacaacatctctctggatctgggcaacaacgctgaagccgtgatcctgcgcgaagatatgctgccgcgtgaaaacttccgccctggcgaccgcgttcgtggcgtgctctattccgttcgcccggaagcgcgtggcgcgcaactgttcgtcactcgttccaagccggaaatgctgatcgaactgttccgtattgaagtgccagaaatcggcgaagaagtgattgaaattaaagcagcggctcgcgatccgggttctcgtgcgaaaatcgcggtgaaaaccaacgataaacgtatcgatccggtaggtgcttgcgtaggtatgcgtggcgcgcgtgttcaggcggtgtctactgaactgggtggcgagcgtatcgatatcgtcctgtgggatgataacccggcgcagttcgtgattaacgcaatggcaccggcagacgttgcttctatcgtggtggatgaagataaacacaccatggacatcgccgttgaagccggtaatctggcgcaggcgattggccgtaacggtcagaacgtgcgtctggcttcgcaactgagcggttgggaactcaacgtgatgaccgttgacgacctgcaagctaagcatcaggcggaagcgcacgcagcgatcgacaccttcaccaaatatctcgacatcgacgaagacttcgcgactgttctggtagaagaaggcttctcgacgctggaagaattggcctatgtgccgatgaaagagctgttggaaatcgaaggccttgatgagccgaccgttgaagcactgcgcgagcgtgctaaaaatgcactggccaccattgcacaggcccaggaagaaagcctcggtgataacaaaccggctgacgatctgctgaaccttgaaggggtagatcgtgatttggcattcaaactggccgcccgtggcgtttgtacgctggaagatctcgccgaacagggcattgatgatctggctgatatcgaagggttgaccgacgaaaaagccggagcactgattatggctgcccgtaatatttgctggttcggtgacgaagcg
氨基酸序列,494aa
NKEILAVVEAVSNEKALPREKIFEALESALATATKKKYEQEIDVRVQIDRKSGDFDTFRRWLVVDEVTQPTKEITLEAARYEDESLNLGDYVEDQIESVTFDRITTQTAKQVIVQKVREAERAMVVDQFREHEGEIITGVVKKVNRDNISLDLGNNAEAVILREDMLPRENFRPGDRVRGVLYSVRPEARGAQLFVTRSKPEMLIELFRIEVPEIGEEVIEIKAAARDPGSRAKIAVKTNDKRIDPVGACVGMRGARVQAVSTELGGERIDIVLWDDNPAQFVINAMAPADVASIVVDEDKHTMDIAVEAGNLAQAIGRNGQNVRLASQLSGWELNVMTVDDLQAKHQAEAHAAIDTFTKYLDIDEDFATVLVEEGFSTLEELAYVPMKELLEIEGLDEPTVEALRERAKNALATIAQAQEESLGDNKPADDLLNLEGVDRDLAFKLAARGVCTLEDLAEQGIDDLADIEGLTDEKAGALIMAARNICWFGDEA

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 楼主| 发表于 2020-7-26 23:26:06 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-3-12 01:01 编辑

硫氧还蛋白(TRX)
硫氧还蛋白是一类广泛存在于几乎所有生物的小氧化还原蛋白。它在许多重要的生物过程中起着重要作用,包括氧化还原信号转导等。对于一些在大肠杆菌中不溶或难溶性的蛋白,硫氧还蛋白( Trx)标签可以促进其以可溶性的方式表达。据报道,一些哺乳动物的细胞因子和生长因子,通过在其C末端融合Trx标签,在某些条件下诱导时,可有效其在大肠杆菌中表达的可溶性。
核苷酸序列:327nt
atgagcgataaaattattcacctgactgacgacagttttgacacggatgtactcaaagcggacggggcgatcctcgtcgatttctgggcagagtggtgcggtccgtgcaaaatgatcgccccgattctggatgaaatcgctgacgaatatcagggcaaactgaccgttgcaaaactgaacatcgatcaaaaccctggcactgcgccgaaatatggcatccgtggtatcccgactctgctgctgttcaaaaacggtgaagtggcggcaaccaaagtgggtgcactgtctaaaggtcagttgaaagagttcctcgacgctaacctggcc
氨基酸序列:109aa
AEIGTGFPFDPHYVEVLGERMHYVDVGPRDGTPVLFLHGNPTSSYVWRNIIPHVAPTHRCIAPDLIGMGKSDKPDLGYFFDDHVRFMDAFIEALGLEEVVLVIHDWGSALGFHWAKRNPERVKGIAFMEFIRPIPTWDEWPEFARETFQAFRTTDVGRKLIIDQNVFIEGTLPMGVVRPLTEVEMDHYREPFLNPVDREPLWRFPNELPIAGEPANIVALVEEYMDWLHQSPVPKLLFWGTPGVLIPPAEAARLAKSLPNCKAVDIGPGLNLLQEDNPDLIGSEIARWLSTLEISG



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 楼主| 发表于 2020-7-27 20:30:44 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-3-12 01:01 编辑

SUMO
SUMO 标签蛋白是一种小分子泛素相关修饰蛋白,是存在于真核生物中高度保守的参与蛋白质小泛素化相关修饰的一类大蛋白。
与GST、MBP 或NusA 相比,SUMO 不仅可以作为重组蛋白表达的融合标签还具备分子伴侣的功能,能促进蛋白的正确折叠,对热和蛋白酶具有耐受性,更有助于保持目的蛋白的稳定性。
此外,SUMO 标签有着与其配套的蛋白酶(专一性强),此蛋白酶识别的是SUMO 的三级结构,切割的特异性极高,不存在任何氨基酸的残留,因此适用于重组蛋白表达。
核苷酸序列,291nt:
Atgtcggactcagaagtcaatcaagaagctaagccagaggtcaagccagaagtcaagcctgagactcacatcaatttaaaggtgtccgatggatcttcagagatcttcttcaagatcaaaaagaccactcctttaagaaggctgatggaagcgttcgctaaaagacagggtaaggaaatggactccttaagattcttgtacgacggtattagaattcaagctgatcagacccctgaagatttggacatggaggataacgatattattgaggctcacagagaacagattggt
氨基酸序列,97aa:
MSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIG

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 楼主| 发表于 2020-7-27 21:31:09 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-2 00:42 编辑

GB1蛋白标签
氨基酸序列如下,57aa:
MDTYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
DNA编码序列为,171nt:
ATGGACACCTACAAACTGATCCTGAACGGTAAAACCCTGAAAGGTGAAACCACCACCGAAGCTGTAGACGCTGCTACTGCAGAAAAAGTTTTCAAACAGTACGCTAACGACAACGGTGTCGACGGTGAATGGACCTACGACGACGCTACCAAAACCTTCACGGTTACCGAA

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 楼主| 发表于 2020-7-27 22:33:31 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-2 00:41 编辑

AviTag标签蛋白
是一个15 个氨基酸的短肽,具有一个单生物素化赖氨酸位点,与已知天然可生物素化序列完全不同,可以加在目标蛋白的N端和C端。融合表达后,可被生物素连接酶生物素化,为了纯化重组蛋白选用低亲和性的单体抗生物素蛋白或抗生物素蛋白衍生物;
氨基酸序列:
GLNDIFEAQKIEWHE
核苷酸序列可以设计为:
GGCCTGAACGACATCTTCGAGGCTCAGAAAATCGAATGGCACGAAGG
特点:   
1.无论在体外或者体内,几乎所有的蛋白都可以在一个独特的Avi Tag位点轻易且有效地被生物素化;
2.生物素化是通过酶和底物的反应来实现,反应条件相当温和而且标记的专一性极高;   
3.生物素AviTag只有15个氨基酸,对蛋白空间结构的影响非常小。
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 楼主| 发表于 2020-10-11 12:14:27 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-2 00:41 编辑

SNAP-Tag
SNAP-Tag
是新一代的蛋白标签技术,不仅专一性极高而且稳定,最大的优点是适用于多种环境下的蛋白质检测与纯化,如活细胞内、溶液中、或固态相(如SDS-PAGE胶)等。
SNAP-Tag是从人的
O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移获得。
无论体内还是体外,SNAP-Tag都能与底物高特异性地共价结合,使蛋白标记上生物素或荧光基团(如荧光素和若丹明)。SNAP所带的活性巯基位点接受了苯甲基鸟嘌呤所携带的侧链苯甲基基团,释放出了鸟嘌呤。这种新的硫醚键共价结合使SNAP所带的目的蛋白携带上了苯甲基基团所带的标记物。苯甲基鸟嘌呤在生化条件下稳定,并且没有其他蛋白会和这类物质作用,所以SNAP标签反应是高特异的。
检测:生物素或各种颜色荧光的底物(如荧光素、若丹明)可渗透进入细胞,方便快捷地进行活细胞内SNAP-Tag融合蛋白的标记与检测。它们也可特异性地标记大肠杆菌,酵母和哺乳动物等细胞抽提液或已经纯化的蛋白液中的SNAP-tag融合蛋白。
将纯化的或未纯化的SNAP-Tag融合蛋白与表面固定了苯甲基鸟嘌呤的基质混合,蛋白即可特异与底物作用,形成共价键,融合蛋白间接被固定在了基质表面上,可以达到更方便快捷地研究蛋白功能或纯化蛋白的目的。

核苷酸序列:546nt
Atggacaaagattgcgaaatgaaacgtaccaccctggatagcccgctgggcaaactggaactgagcggctgcgaacagggcctgcatgaaattaaactgctgggtaaaggcaccagcgcggccgatgcggttgaagttccggccccggccgccgtgctgggtggtccggaaccgctgatgcaggcgaccgcgtggctgaacgcgtattttcatcagccggaagcgattgaagaatttccggttccggcgctgcatcatccggtgtttcagcaggagagctttacccgtcaggtgctgtggaaactgctgaaagtggttaaatttggcgaagtgattagctatcagcagctggcggccctggcgggtaatccggcggccaccgccgccgttaaaaccgcgctgagcggtaacccggtgccgattctgattccgtgccatcgtgtggttagctctagcggtgcggttggcggttatgaaggtggtctggcggtgaaagagtggctgctggcccatgaaggtcatcgtctgggtaaaccgggtctggga
氨基酸序列:182aa
MDKDCEMKRTTLDSPLGKLELSGCEQGLHEIKLLGKGTSAADAVEVPAPAAVLGGPEPLMQATAWLNAYFHQPEAIEEFPVPALHHPVFQQESFTRQVLWKLLKVVKFGEVISYQQLAALAGNPAATAAVKTALSGNPVPILIPCHRVVSSSGAVGGYEGGLAVKEWLLAHEGHRLGKPGLG

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 楼主| 发表于 2020-10-11 17:32:27 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-2 00:41 编辑

c-myc标签:
是MYC癌蛋白的一个10肽残基,是一个很小的标签蛋白,有其特异的相应抗体,可以用于WB杂交技术,免疫沉淀和流式细胞术,用于检测重组蛋白在靶细胞中的表达,c-myc变迁可以放在重组蛋白的C端或者N端,在低pH洗脱条件下可以降低蛋白质的活力,因此myc标签系统广泛用于检测但是很少用于纯化。
c-myc标签氨基酸序列为EQKLISEEDL
核苷酸序列可以设计为:
GAACAGAAGCTGATCTCTGAAGAAGACCTG
或者
GAGCAGAAACTCATCTCTGAAGAGGATCTG


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 楼主| 发表于 2020-10-11 23:27:05 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-1 17:16 编辑

HA 标签:
来源于人流感病毒血凝素(HA)蛋白短氨基酸序列。HA 标签是目前广泛应用的表位标签之一。 可以融合到目的蛋白的 C 端或 N 端,抗 HA 标签抗体可用于 HA 标记的靶蛋白的检测、分离和纯化,而无需蛋白特异性抗体或探针。
HA基因可以设计为以下的序列:
TACCCATACGATGTTCCAGATTACGCT
或者是
TACCCATACGACGTTCCAGACTACGCT
HA标签的氨基酸序列是
YPYDVPDYA

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本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-1 22:49 编辑

V5 标签:
是从猿猴病毒 5 (SV5) 的 P 蛋白和 V 蛋白中分离得到的第 95 - 108 位氨基酸残基组成的多肽。V5 标签常被融合表达于靶蛋白的 N 末端或者 C 末端,以便对靶蛋白进行分析和鉴定。
氨基酸序列:
GKPIPNPLLGLDST
核苷酸序列:
GGTAAGCCTATCCCTAACCCTCTCCTCGGTCTCGATTCTACG
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 楼主| 发表于 2020-10-11 23:30:53 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-1 22:49 编辑

S-tag :
利用RNA酶S的N端的S-肽段与S蛋白之间的紧结合,S标签系统使用了S-肽段N端的1-15个氨基酸残基,还有固定在琼脂糖微球上的S-蛋白来纯化目标蛋白质。
核苷酸序列可设计为:
AAAGAAACCGCTGCTGCTAAATTCGAACGCCAGCACATGGACAGC
氨基酸序列:
KETAAAKFERQHMDS
S-标签是个融合肽标签,可以通过快速灵敏的均匀分析或者在Western blot中用比色法加以检 测。该系统的基础是15个氨基酸残基的S-tag与103氨基酸残基的S-蛋白质之间的强烈相 互作用,这两个都来自RNaseA(Karpeiskyet al.1994; Kim  和 Raines 1994)。S-蛋白质/S- 标签复合物的Kd接近0.1μM,这取决于pH,温度和离子强度(Connelly etal. 1990)。
标签由4 个带正电荷残基,3个负电荷残基,3个不带电的极性残基和5个非极性残基组成。这使S-标签保 持可溶。S-标签的快速分析是基于核酸降解活力的恢复。标签蛋白可以结合到S蛋白质基质上。  
洗脱条件较苛刻,如pH2.0的缓冲液。然而为了获得有功能的蛋白质推荐用蛋白酶切割标签。该系统可用于纯化的重组蛋白质来源包括细菌(Lellouch和Geremia 1999),哺乳细胞和杆状病毒感染的昆虫细胞抽提物。该系统经常与第二标签联用。
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