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楼主: 傲慢与偏见

Rapid Construction of a Replication-Competent Infectious Clone of Human A

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 楼主| 发表于 2019-3-8 16:40:13 | 显示全部楼层
重组病毒感染A549细胞后三天,负染法处理样品,FEI Tecnai-12 电镜下可以看到典型的腺病毒颗粒,70-90nm大小。

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 楼主| 发表于 2019-3-9 23:12:48 | 显示全部楼层
在挑取的12个菌落中,除了三个阳性质粒外,其他九个未能成功构建的质粒大小和pBR322质粒大小相似。
经过测序发现,是pBR322在ECoR I酶切位点处恰好多了一个AsiS I酶切位点。
根据Gibson组装原理可以看到因为AsiS I是一个回文结构序列,产生这种多了一个AsiS I酶切位点的质粒有很大的可能性,能解释通。


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 楼主| 发表于 2019-3-10 11:38:58 | 显示全部楼层
本帖最后由 傲慢与偏见 于 2019-3-10 18:17 编辑

2005年,HAdV-B14 重新在美国,加拿大,欧洲,亚洲等多地出现,导致越来越多的ARD爆发,严重者致死。目前,针对HAdV-B14感染尚无有效预防和治疗的的疫苗和抗病毒药物,HAdV-B14感染性克隆的成功构建会有助于研究病毒基因组功能,致病性机理,重组机制,以及研制抗病毒药物和疫苗。
对于大基因组病毒的感染性克隆的构建,目前常用的手段是利用同源重组技术,常用的同源重组菌有,E. coli BJ5183, GB05-dir, 或者预转pKD46质粒的DH10B。采用同源重组技术的缺点是比较耗时,同源臂要求比较长(500bp),筛检和鉴定阳性克隆比较麻烦,可重复性差。同源重组的方法差不多用时7-14天,Gibson组装用时低至3天。
本文中先后两次用Gibson组装构建HAdV-B14的感染性克隆,第一次从4个菌落中筛选到一个阳性克隆,第二次从八个菌落中筛选到两个阳性克隆。
Gibson组装简单,有效,耗时短,阳性率高,重复性好,也用于其他,如菜豆皱缩花叶病毒,植物RNA病毒基因组的组装。同源重组的方法构建感染性克隆需要用含有重组酶的特殊菌株,由于腺病毒基因组较大,含有一些重复序列或者高级二级结构,所以在构建质粒的过程中可能发生一些意想不到的重组,造成核苷酸增加,缺失,或者重排等等,对于质粒的感染性来说可能是致死性突变。
而Gibson组装发生这些突变的概率非常小。
质粒pBRAdV14的获得为HAdV-B14复制缺陷型载体的研究提供了基础,从而进行疫苗开发和基因治疗的研究。目前,传统的腺病毒载体主要是基于C型的HAdV-5和HAdV-2构建的,但是由于这两型病毒广泛的自然感染,所以很多人体内存在预先免疫,因此这些传统腺病毒载体的广泛应用受到限制。HAdV-B14病毒是一种突发型病原体,不存在预先免疫,可以尝试开发为一个新型腺病毒载体。


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