常用质粒载体中-抗生素基因序列

黄帮主 · 发表于 2020-5-4 21:09:47

本帖最后由黄帮主于 2021-10-16 09:59 编辑

免疫调节因子：
① 血浆组织型纤溶酶激活剂TPA：能诱导TH1和TH2反应
ATGGATGCAATGAAGAGAGGGCTCTGCTGTGTGCTGCTGCTGTGTGGAGCAGTCTTCGTTTCG
② CPG序列：能诱导体内强烈的免疫反应TCGTCGTTTGTCGTTTTGTCGTTT
③ PADRE序列：通用的辅助性T细胞表位
GCCAAATTTGTGGCCGCCTGGACCCTGAAAGCCGCCGCCAKFVAAWTLKAAA

黄帮主 · 发表于 2020-7-18 18:04:54

本帖最后由黄帮主于 2021-10-16 10:28 编辑

IL-2信号肽序列
氨基端序列：
MYRMQLLSCIALSLALVTN
信号肽序列:
atgtacaggatgcaactcctgtcttgcattgcactaagtcttgcacttgtcacgaattcg

黄帮主 · 发表于 2020-7-18 19:35:23

本帖最后由黄帮主于 2023-10-26 16:33 编辑

载体复制子，启动子序列：
pBAD启动子：30楼
plac：26楼
tac：26楼
F1 ori：27楼
T7/SP6启动子：24楼
U6启动子：31楼
AraC乳糖操纵子：29楼
SV40 polyA：21楼
SV40 终止子序列：22楼
SV40 ori：28楼
CMV：32楼

SV40poly(A)序列gatacattgatgagtttggacaaaccacaactagaatgcagtgaaaaaaatgctttatttgtgaaatttgtgatgctattgctttatttgtaaccattataagctgcaataaacaagtt

黄帮主 · 发表于 2020-7-18 20:05:45

本帖最后由黄帮主于 2021-10-16 09:44 编辑

SV40_PA_terminator 228nt
GATCATAATCAGCCATACCACATTTGTAGAGGTTTTACTTGCTTTAAAAAACCTCCCACACCTCCCCCTGAACCTGAAACATAAAATGAATGCAATTGTTGTTGTTAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGGTTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTTGTCCAAACTCATCAATGTATCTTA

黄帮主 · 发表于 2020-12-26 10:00:16

AraC乳糖操纵子：核苷酸序列 906bp
ATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGCCAACGGTTATCTCGATTTTTTTATCGACCGACCGCTGGGAATGAAAGGTTATATTCTCAATCTCACCATTCGCGGTCAGGGGGTGGTGAAAAATCAGGGACGAGAATTTGTTTGCCGACCGGGTGATATTTTGCTGTTCCCGCCAGGAGAGATTCATCACTACGGTCGTCATCCGGAGGCTCGCGAATGGTATCACCAGTGGGTTTACTTTCGTCCGCGCGCCTACTGGCATGAATGGCTTAACTGGCCGTCAATATTTGCCAATACGGGGTTCTTTCGCCCGGATGAAGCGCACCAGCCGCATTTCAGCGACCTGTTTGGGCAAATCATTAACGCCGGGCAAGGGGAAGGGCGCTATTCGGAGCTGCTGGCGATAAATCTGCTTGAGCAATTGTTACTGCGGCGCATGGAAGCGATTAACGAGTCGCTCCATCCACCGATGGATAATCGGGTACGCGAGGCTTGTCAGTACATCAGCGATCACCTGGCAGACAGCAATTTTGATATCGCCAGCGTCGCACAGCATGTTTGCTTGTCGCCGTCGCGTCTGTCACATCTTTTCCGCCAGCAGTTAGGGATTAGCGTCTTAAGCTGGCGCGAGGACCAACGTATCAGCCAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAA

氨基酸序列：302aa
MAGVZKVWLKRKMIPCCRDTRLMPIWWRVZRRLRPTVISIFLSTDRWEZKVIFSISPFAVRGWZKIRDENLFADRVIFCCSRQERFITTVVIRRLANGITSGFTFVRAPTGMNGLTGRQYLPIRGSFARMKRTSRISATCLGKSLTPGKGKGAIRSCWRZICLSNCYCGAWKRLTSRSIHRWIIGYARLVSTSAITWQTAILISPASHSMFACRRRVCHIFSASSZGLASZAGARTNVSARRSCFZAPPGCLSPPSVAMLVLTINSISRGYLKNAPGPARASSVPVVKKKZMMZPSSCHNWZ

黄帮主 · 发表于 2021-5-7 12:27:14

人IgG1恒定区序列：
GCTTCGACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAAAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGA

氨基酸序列：
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGKZ

黄帮主 · 发表于 2022-8-23 17:03:28

信号肽序列有来自 E.coli 外膜蛋白的信号肽（如主要外膜蛋白 A，OmpA）和周质蛋白的信号肽（如碱性磷酸酶 PhoA），以及果胶裂解酶 B（pelB）。

黄帮主 · 发表于 2023-7-28 13:55:40

IRES序列
CCCCTCTCCCTCCCCCCCCCCTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGCAGGCAGCGGAACCCCCCACCTGGCGACAGGTGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATAA

黄帮主 · 发表于 2023-7-28 13:57:07

TRX蛋白来自pET-32A(+)质粒，107aa，12kd左右

还原蛋白质二硫键的催化剂。虽然不属于分子伴侣的范畴，但它作为原核生物的组成蛋白，具有与分子伴侣相似的功能。

大肠杆菌胞内蛋白，容易过表达，即使表达至细胞总蛋白质的40%以上仍然是可溶性的，在重组蛋白制备中可以用作可溶性标签来避免包涵体的形成。

硫氧化蛋白会聚集在细胞质膜的黏附位点上，使得硫氧化蛋白能够经简单的渗透压或冻融处理释放出来，完成简单的初步纯化。

核苷酸序列
ATGAGCGATAAAATTATTCACCTGACTGACGACAGTTTTGACACGGATGTACTCAAAGCGGACGGGGCGATCCTCGTCGATTTCTGGGCAGAGTGGTGCGGTCCGTGCAAAATGATCGCCCCGATTCTGGATGAAATCGCTGACGAATATCAGGGCAAACTGACCGTTGCAAAACTGAACATCGATCAAAACCCTGGCACTGCGCCGAAATATGGCATCCGTGGTATCCCGACTCTGCTGCTGTTCAAAAACGGTGAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCCGGTTCTGGTTCTGGCCAT
氨基酸序列
MSDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGSGH

黄帮主 · 发表于 2023-8-4 22:11:27

本帖最后由黄帮主于 2023-9-2 12:54 编辑

ROP蛋白：和质粒的拷贝数相关，pBR322载体上，低拷贝
核苷酸序列 192bp
ATGACCAAACAGGAAAAAACCGCCCTTAACATGGCCCGCTTTATCAGAAGCCAGACATTAACGCTTCTGGAGAAACTCAACGAGCTGGACGCGGATGAACAGGCAGACATCTGTGAATCGCTTCACGACCACGCTGATGAGCTTTACCGCAGCTGCCTCGCGCGTTTCGGTGATGACGGTGAAAACCTCTGA
氨基酸序列 64aa
MTKQEKTALNMARFIRSQTLTLLEKLNELDADEQADICESLHDHADELYRSCLARFGDDGENL

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