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楼主: 黄帮主

常用质粒载体中-抗生素基因序列

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 楼主| 发表于 2023-8-4 22:11:47 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-10-26 16:42 编辑

噬菌体上存在的一些序列:
COS序列 42楼

这个网站是我建设的,我把她当成一个整理本在使用,喜欢的话欢迎你也来用。
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 楼主| 发表于 2023-8-4 22:18:39 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-10-26 16:42 编辑

噬菌体cos序列是噬菌体基因组中的一个特殊序列,它的作用是在噬菌体DNA复制和包装过程中起到关键的连接作用。
12nt,位于
菌体的两头,噬菌体复制时,DNA链被解开,形成两条单链。
λ噬菌体基因组为双链DNA线状分子,长48502bp,两端为长12个核苷酸的单链DNA粘性末端。噬菌体进入宿主细胞后,粘性末端配对形成闭环DNA。
COS序列:GGGCGGCGACCT


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 楼主| 发表于 2023-8-6 11:39:41 | 显示全部楼层
1977年Boliver等构建了pBR322质粒。该质粒是经人工构建的大肠杆菌质粒载体,并按照标准质粒载体命名法则命名的:p表示质粒,BR取自该质粒两位主要构建者的姓氏的头一个字母,322系指实验室编号,以与其他质粒载体如pBR325、pBR327、pBR328等相区别。pBR322质粒构建来源于三个天然质粒的部分组成。①pSF2124质粒转座子Tn3的氨苄青霉素抗性基因(ampr);②pSC101质粒的四环素基因(tetr);③Co1E1的派生质粒pMB1的DNA复制起点(ori)。多年来,pBR322质粒被广泛采用并经改进,产生了更多有用的质粒。

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 楼主| 发表于 2023-8-14 11:01:10 | 显示全部楼层
IPTG的作用:
是一种含硫的乳糖类似物。
这种类似物在没有乳糖的条件下,它可以诱导细胞合成β-半乳糖苷酶。所以我们称IPTG为β-半乳糖苷酶的诱导剂,亦即不发生代谢变化的诱导物。
在X-gal显色反应中,β-半乳糖苷酶同样也需要诱导
X-gal:无色的底物,可以被β-半乳糖苷酶切成半乳糖和深蓝色的底物-靛蓝


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 楼主| 发表于 2023-9-2 15:47:46 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-9-2 16:07 编辑

LAC promoter
tttacactttatgcttccggctcgtatgtt

lac启动子是可诱导的启动子。在正常情况下lac 启动子被LacI 阻遏物抑制,无法启动。当培养基内加入IPTG,LacI 阻遏物就会失去功能,lac启动子因而开始作用。lac 启动子-35 区的序列为TTTACA,-10 区为TATAAT。


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 楼主| 发表于 2023-9-12 21:55:36 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-9-12 22:06 编辑

合成库中NNK设计:
NNK密码子 (N代表腺嘌呤,胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤核苷酸;K代表胸腺嘧啶和鸟嘌呤),

① 连续使用10个NNN密码子后,引入停止密码子的概率超过50%,而使用NNK,在连续使用16次,引入终止密码子的概率超50%。
② NNK能编码所有20种氨基酸,一种终止密码子,NNN则三种终止密码子均能编码。
③ TAG密码子在TG1中被翻译成谷氨酰胺,从而消除了终止密码子的影响。
④ 使用NNK引物减少密码子冗余,这种设计增加了引入氨基酸的可能性比如色氨酸,它只由一个密码子编码。






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 楼主| 发表于 2023-10-26 16:39:23 | 显示全部楼层
λ噬菌体基因组为双链DNA线状分子,长48502bp,两端为长12个核苷酸的单链DNA粘性末端。噬菌体进入宿主细胞后,粘性末端配对形成闭环DNA。

λ噬菌体的两个末端序列为:GGGCGGCGACCT
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λ噬菌体基因组为双链DNA线状分子,长48502bp,两端为长12个核苷酸的单链DNA粘性末端。噬菌体进入宿主细胞后,粘性末端配对形成闭环DNA。

λ噬菌体的两个末端序列为:GGGCGGCGACCT
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 楼主| 发表于 2023-10-26 16:39:23 | 显示全部楼层
本帖最后由 黄帮主 于 2023-11-1 19:30 编辑

λ噬菌体基因组为双链DNA线状分子,长48502bp,两端为长12个核苷酸的单链DNA粘性末端。噬菌体进入宿主细胞后,粘性末端配对形成闭环DNA。

λ噬菌体的两个末端序列为:GGGCGGCGACCT




蛋白基因:
cherry蛋白基因(711nt)12楼
GFP蛋白基因(720nt)13楼
eGFP蛋白基因(798nt)14楼
hrGFP蛋白基因(711nt)15楼
Trx蛋白:11楼
eCFP蛋白:16楼
泛素蛋白:19楼
M13噬菌体PIII蛋白:23楼
信号肽序列:
pelB信号肽:25楼
IL-2信号肽:20楼


IRES序列:10楼
免疫调节因子:17楼
IgG1抗体恒定区序列:33楼
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