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The SARS-CoV S glycoprotein: expression and functional characterization

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发表于 2020-4-8 13:34:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
The SARS-CoV S glycoprotein: expression and functional characterization


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 楼主| 发表于 2020-4-8 13:37:08 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-13 17:23 编辑

摘要笔记:
定位S糖蛋白的RBD受体结合区。
构建和表达Tor2病毒株的S蛋白不同片段,表达全长S蛋白的细胞和受体表达细胞在中性PH下能融合,形成合胞体。
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 楼主| 发表于 2020-4-8 13:46:35 | 显示全部楼层
背景资料:
SARS病毒的S蛋白和其他冠状病毒的S糖蛋白相比较,除了S2区有一些保守序列存在外,同源性非常低,氨基酸序列一致性只有20-27%。
本文构建了S蛋白不同区域的表达载体,定位和ACE2结合的RBD区,
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 楼主| 发表于 2020-4-8 14:42:20 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-9 10:22 编辑

实验所用材料:
根据计算机模拟,合成一系列短多肽,用于免疫新西兰兔,取血清,ELISA和WB检测兔血清中多抗和S蛋白特异性结合能力。有两株短肽免疫后的兔血清效价最高,特异性最好,选其进行本课题中的实验。
D24: DVQAPNYTQHTSSMRGC
P540:PSSKRFQPFQQFGRDC
此外,一株商品化多抗IMG-542,能识别S蛋白的288-303位。
pCDNA3-ACE2质粒,含ACE2编码基因。
pCDNA3-ACE2-ecto, 含可溶性表达ACE2蛋白基因。
MA. VTF7.3(重组痘病毒,表达T7 RNA聚合酶),VCB21R
pSecTag2质粒。


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 楼主| 发表于 2020-4-8 17:08:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-8 22:18 编辑

载体构建:
毒株来源于SARS TOR2.
S蛋白为1255个aa。


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 楼主| 发表于 2020-4-8 22:26:05 | 显示全部楼层
蛋白表达:
构建的一系列真核表达载体转染Vero E6或者293细胞。
转染后4小时,用表达T7聚合酶的VTF7.3重组痘病毒感染细胞,在细胞上清中可以获得可溶性蛋白。
全长S糖蛋白主要存在于细胞裂解物中。

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 楼主| 发表于 2020-4-9 00:01:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-12 19:30 编辑

SARS S蛋白从N端到C端分为S1、S2、跨膜区和胞内结构域4个部分。
本研究中构建的真核表达载体包括:
① 全长S蛋白 (1255个aa)
② 胞外区Se (17–1189位aa)
③④⑤ 截短的S蛋白N区(S276, S537, S756,)
⑥ S蛋白中间区(S272–537)
信号肽区为S蛋白的前16位或者鼠类k链前导链。
S蛋白的758-761位为RNTR,这个基序是一个通用的前提转化酶识别切割的序列K/R–Xn–K/R (n=0, 2, 4 ,6)
所以推测前756位为S1蛋白,其他冠状病毒如JHM的S1为769个aa,OC43的S1为778aa,不过也有冠状病毒S1区域比较短,如229E的S1只有537aa。
所有的真核表达载体,含一个c-MYC标签和一个HIS标签。
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 楼主| 发表于 2020-4-12 14:48:01 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-12 15:03 编辑

免疫沉降和蛋白纯化:
上清中的表达蛋白和Ni–NTA或者加有特异性抗体的PROTEIN G凝胶进行结合,进行蛋白电泳。
细胞沉淀用NP-40和PMSF裂解后,电泳或者WB检测。由图A狭缝杂交图可见,S蛋白的各真核载体直接转染VERO E6/293细胞中,表达量非常低。
加表达T7聚合酶的痘病毒(VTF7.3)感染后,表达量飙升!
蛋白大小和表达量呈相关性,小蛋白表达量高,大蛋白表达量低。

抗体用anti-c-Myc进行狭缝杂交和WB检测,两实验结果一致。

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 楼主| 发表于 2020-4-12 15:19:38 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-12 18:51 编辑

用制备的兔多抗对几种S蛋白再进行WB检测:结果如图,D24和几种S蛋白均结合,P540抗体能识别S576,Se,全长S蛋白,不和小片段S结合。
另外,P540多抗灵敏性比D24要好,使用时稀释度可以达到1:10000.

细胞表面上存在S全长蛋白,流式检测到有较低量的表达。

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 楼主| 发表于 2020-4-12 20:27:13 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2020-4-13 15:20 编辑

S蛋白电泳大小比预测值稍大
S276 75KDa
S537 100-110KDa
S576 130-140KDa
Sc/S 200KDa

实验中观察到所有转染S真核表达载体的细胞没有发生细胞病变。

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