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从纯化到星辰,蛋白纯化文献笔记

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发表于 2024-9-18 20:26:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 青花瓷 于 2024-9-23 22:26 编辑

从纯化到星辰 蛋白质纯化笔记
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 楼主| 发表于 2024-9-18 22:09:45 | 显示全部楼层
resin重悬成50%slurry
先封闭柱子的下出口,往柱子里面加入10%体积的buffer
slurry的时候还得用玻棒引流,这样可以尽可能的避免气泡。
resin沉降30min后,打开柱子的下出液口,让多余的缓冲液流出去。
可以防止resin 不均匀,避免产生一大堆气泡。

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 楼主| 发表于 2024-9-19 00:03:33 | 显示全部楼层
本帖最后由 青花瓷 于 2024-9-19 00:07 编辑

测试凝胶过滤层析柱是否成功装柱,使用蓝色葡聚糖(blue dextran)进行验证。
蓝色葡聚糖是带有蓝色染料的多糖高分子聚合体,体积非常大,所以在空体积(void volume,即树脂之外的空隙容积)可以洗脱出来,这一步实验作用有三。
① 确定void volume,知道这个空体积是很重要的。因为每次装柱子,实际resin的总体积都会有微小的不同。特定蛋白在柱子的洗脱体积与空体积的比值是一定的,所以只要知道了空体积,就能知道蛋白大概会在什么时候洗脱出来。
② 可以确定样品会被稀释多少。
③ 可以判断柱子是否装的均匀。如果装的不均匀,葡聚糖就会跑得形状怪异。



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 楼主| 发表于 2024-9-19 09:19:15 | 显示全部楼层
蛋白活性鉴定:

① 凝胶迁移率变动分析


② DNA水解酶I足迹分析

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 楼主| 发表于 2024-9-19 20:06:03 | 显示全部楼层
去垢剂是一类具有特殊结构的化合物,能够破坏细胞膜中的磷脂双层结构,使跨膜蛋白从膜上解离。通过添加适量的去垢剂,可以有效地实现跨膜蛋白的分离。
如:Triton X-100 Sodium Cholate胆酸钠 ChapsOctyl glucoside辛基葡糖苷


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 楼主| 发表于 2024-9-23 08:44:00 | 显示全部楼层
Amersham XK26/40的空柱子,然后往里面填充Sephacryl S-300 HR 的树脂。
用于凝胶过滤层析。
Sephacryl S-300 HR 的树脂的分辨率比Superdex要低。
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